Narazil jsem na stejny problem.

Soubor

settings.inc.php

je od 1.7 deprecated, takze jeho editace zrejme nepomuze.

V prispevku Enabling SSL in PrestaShop – Tips and issues jsem narazil na moznost zapnuti SSL v databazi pomoci:

UPDATE ps_configuration SET `value`=1 WHERE `name`="PS_SSL_ENABLED"

Takze je potreba vlezt do PHPAdminu (Endora webadmin -> Databaze MySQL -> InnoDB a vybrat databazy pro upravovanou domenu).